离子色谱仪主要用于环境、食品、生物、医学、化工等领域中常见阴、阳离子的检测分析，是高效液相色谱的一种，是用来分析阴阳离子的色谱方法。下面是离子色谱仪在使用前须了解下面这些事项：
1、流动相瓶中滤头要注意始终处于液面以下，防止将溶液吸干。
2、启动泵前观察从流动相瓶到泵之间的管路中是否有气泡，如果有则应将其排除。
排除方法如下：先将与泵相连的塑料流路接头拧下来，用洗耳球吸满去离子水，从与泵段相连的流路管中注入，将流路管中的气泡排除干净。然后再将流动相瓶（一般为去离子水瓶）抬高，再将流路接头与泵连接好。启动泵，打开泵内排气阀选钮，将泵内气泡排除干净，一般观察为流出液比较均匀，再将泵排气阀拧紧。（注意：此项操作时，整个流路是与色谱柱断开的）
3、用去离子水或流动相清洗整个流路时，可以采用大流量清洗（一般可将流量设置为2.0ml/min，但不能再太大）以缩短清洗时间，但在通流动相接色谱柱时需要将流量调整为色谱柱使用流量条件。
离子色谱仪在环境监测中的应用也非常广泛：
在新时代的条件下，经济的发展带动了科技的发展进步，在环境检测中色谱仪已经进入了广泛使用，因此离子色谱技术已得到充分的研究和发展空间，逐渐在许多地方应用，其在环境监测中的应用也非常广泛，有效提高环境监测水平。随着科学技术水平的迅速发展，环境监测不仅是对简单的有机物进行分离和监测，而且包含了对环境中的无机物进行分离与监测。色谱仪已成为环境监测中重要的技术之一。
根据当前的环境保护标准，在涉及阴离子和阳离子分析的大气、水、土壤和其他环境测试中，许多地方还是在利用经典方法进行检测，比如，进行使用分光光度法和电极法，这些方法在处理各种复杂的化合物比较有效。随着社会对环境监测要求越来越高，在环境监测的过程中要保证数据的准确性，而且还要对分析方法进行改进，而科学技术的发展使得色谱仪已经成为了环境检测的重要仪器，利用色谱仪不仅能够提高环境检测数据的有效性和准确性，而且具有高效率，往往需要的样品量很少，就能够进行检测，并且具有无污染、灵敏度高等特点，目前这种方法已经被广泛应用在了对工业废水、饮用水以及工业生产中产生的废气的检测当中。
快速发展的科技对数据准确性的要求越来越高，因此检测类仪器在使用中的稳定性对于检测分析实验是至关重要，离子色谱仪仪器设备除了定期申请相关检测部门上门检测以外，在日常的应用中也应该按照要求进行自检自查。
离子色谱仪是液相色谱的一种，是分析离子的一种液相色谱方法。离子色谱法作为传统的分离分析方法，具有分析速度快、检测灵敏度高、选择性好，能同时分离多种离子并能将一些非离子物质转变成离子性物质进行测定等优点。绝大多数的有机和无机阴阳离子往往都是分析对象，在环境化工、食品化工、电子、生物医药及新材料等领域应用广泛。